Tobiasz Bocheński, radny Prawa i Sprawiedliwości, zapowiedział, że na najbliższych sesjach rady miejskiej będą domagać się zmiany tych wytycznych. W jego ocenie, zarządzenie Trzaskowskiego "wykracza poza kompetencje prawne prezydenta" i jest "absurdalną agendą lewicową". Bocheński tłumaczył, że w państwie polskim Kościół jest rozgraniczony od państwa, a krzyże należy postrzegać jako symbol kulturowy, a nie narzędzie indoktrynacji religijnej.

Z kolei poseł Suwerennej Polski Sebastian Kaleta zapowiedział złożenie zawiadomienia do prokuratury, aby zbadała, czy w tym przypadku nie doszło do "przestępstwa przekroczenia uprawnień" przez prezydenta Warszawy. Kaleta uważa, że decyzja Trzaskowskiego narusza Konstytucję, która gwarantuje wolność religii. Określił to jako "wojnę ideologiczną" prezydenta stolicy.

Jacek Ozdoba, również z Suwerennej Polski, skrytykował postawę Trzaskowskiego, który - jego zdaniem - zamiast zająć się realnym problemem, jakim jest pożar centrum handlowego przy ulicy Marywilskiej, rozpoczął "wojnę ideologiczną" w Warszawie. Ozdoba zaapelował przy tej okazji do Trzaskowskiego o szybkie uruchomienie pomocy dla poszkodowanych kupców.

Eksperci zwracają uwagę, że w 2011 r. Europejski Trybunał Praw Człowieka orzekł, iż obecność krzyży w szkołach nie stanowi indoktrynacji religijnej, a jest raczej symbolem kulturowym, związanym z dziedzictwem europejskiej cywilizacji. Nie ma także w Polsce przepisów, które opierałyby się na doktrynach religijnych.

Decyzja Trzaskowskiego w oczywisty sposób jest więc postrzegana jako ideologiczna walka z Kościołem i chrześcijańskimi wartościami. Zapowiadają oni podjęcie konkretnych działań prawnych, aby temu przeciwdziałać. Spór ten może eskalować i stać się kolejną osią konfliktu politycznego w nadchodzącej kampanii wyborczej.

Kwestia ekspozycji symboli religijnych w urzędach jest niezwykle delikatna i dotyka fundamentalnych kwestii światopoglądowych. Trzaskowski, broniąc świeckości państwa, zdaje się ignorować głęboko zakorzenione tradycje i przywiązanie Polaków do wiary katolickiej.